En 863 Enchin presentó a la Corte Imperial sus logros durante el viaje a la China Tang con el objetivo de solicitar permiso para obtener la certificación oficial para transmitir el Dharma. El 29 de mayo del 866 la Corte emitió un documento oficial del departamento de Estado, autorizando la propagación de la enseñanzas budistas de Shingon y Tendai Shikan, y reconociendo formalmente los estudios de Enchin.

Enchin revitalizó Miidera como un templo anexo de la rama budista de Tendai, recibió el palacio Jijuden del emperador Seiwa y allí estableció To-in. En To-in (que significa “Sala de Tang”) se conservan los valiosos textos e imágenes traídos por Enchin. Estos materiales de valor incalculable han influido significativamente en el desarrollo del budismo esotérico de Tendai y el budismo japonés en general. Sus enseñanzas y logros fueron la base de la fundación del estatus único de Miidera como templo principal de la congregación Tendai Jimon.

En el año 868 le encomendaron promover el budismo Tendai y se convirtió en el quinto superior principal de la congregación budista de Tendai.

En el año 887 pudo ordenar dos monjes para las divinidades protectoras de las montañas de Daihiei y Kohiei, contribuyendo al establecimiento del culto religioso de Sanno en el monte Hiei. Después, Enchin comenzó importantes renovaciones en el complejo Konpon Chudo del templo de Enryaku-ji entre el 882 y 888, distribuyendo su disposición en nueve secciones, cuatro salas laterales con aleros, configurando un estilo arquitectónico todavía vigente hoy.

Enchin murió en el año 891 con 78 años de edad, tras servir como superior principal durante 23 años, haciendo más firmes las bases del budismo Tendai y el templo Enryaku-ji, y dedicando su vida al florecimiento de las enseñanzas budistas.