“智證大師”
弘仁5年（814年）出生於現在的香川縣善通寺市。父親為和氣氏，母親是空海的侄女。15歲時登比叡山，成為義真（778～833年）門下弟子。仁壽3年（853年），在其40歲時渡海至唐，於天台山和長安學習天台學和密教後傳至日本。從唐帶回的經典藏於三井寺的唐院，並就任第一代長吏（住持），將三井寺做為天台別院，奠定日後發展為天台宗寺門派總本山的基礎。貞觀10年（868年）成為第五代天台座主，為興盛佛法鞠躬盡瘁23年以上。寬平3年（891年）10月29日圓寂。
“清和天皇”
平安時代前期的天皇。文德天皇的四皇子。母親為藤原明子。名惟仁，也稱水尾帝。因即位時尚年幼，由外祖父藤原良房攝政。皈依佛道，於元慶3年（879年）剃度出家。法名素真。（在位期間858～876年）（生卒年850～880年）
“傳法灌頂”
重要的宗教儀式，傳授密教秘法以繼承阿闍梨（導師、上師）位時舉行的儀式。源自古印度王和王子即位時以水灌灑頭頂的儀式。
“豐臣秀吉”
安土桃山時代的武將。最初跟隨織田信長，在天正10年（1582年）信長死於本能寺之變後，立即以其繼承者之姿，消滅敵對勢力，完成一統天下的霸業。天正11年（1583年）著手興建大阪城，城內五層八重的天守閣象徵其霸主的地位。在秀吉被稱為「豐太閣」的時代，華麗絢爛的桃山文化蓬勃發展，茶道和狩野派繪畫均是此文化的代表。
秀吉與三井寺的關係大致維持良好，然而在其晚年的文祿4年（1595年），突然下令拆除三井寺。秀吉於慶長3年（1598年）8月逝世之後，他的妻子北政所又重建了三井寺。
“毀壞”
原文「闕所」，意為欠缺領主的土地。在鎌倉、室町時代，由於領主犯罪等原因，被幕府沒收、尚未指定新領主的領地。稱為闕所地。另外也指沒收領土和其他財產。
“寶形造”
攢尖頂式屋頂。正方形的建築物內，垂脊朝屋頂中央聚集。也稱方形造。
“檜樹皮屋頂”
剝下檜木的外樹皮做成檜皮，並以竹釘固定葺法層疊鋪設的屋頂。
“黃不動尊”
日本三大不動尊之一。也稱金色不動明王。此畫作原型是三井寺的祖師智證大師圓珍（814～891年）將其在比叡山修行時悟得的姿態描繪下來的畫像。這是描繪不動明王的最古老的佛畫，被指定為國寶。鎌倉時代，依據此畫像雕刻而成的尊像均成為秘佛。智證大師一生守護的黃不動尊，非常靈驗，因而超越宗派備受信仰，三井寺也成為不動信仰的中心寺院之一。
重要文化財產
唐院大師堂
